Головними способами діагностики уреаплазмозу в даний час є: метод полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Якщо ПЛР виявляє присутність в організмі людини уреаплазми, то це означає, що є необхідність надалі проведення діагностики. Аналіз за допомогою ПЛР проходить протягом п'яти годин, а його результати досить конкретні і точні. Але, тим не менш, метод ПЛР не підходить для швидкої перевірки результатів здійсненого лікування, оскільки за допомогою ПЛР можна отримати позитивний результат навіть у разі присутності в організмі слідів інфекції, які зберігаються ще протягом двох - трьох тижнів. Виходячи з цього, після завершення терапії, діагностувати результати лікування методом ПЛР можливо не раніше ніж через два - три тижні після того, як була випита остання таблетка. Але, незважаючи на це, негативний результат ПЛР майже завжди говорить про відсутність уреаплазми в організмі пацієнта. При виявленні причин безпліддя, викидня, запальних захворювань у післяпологовому періоді задіюється серологічний спосіб діагностики уреаплазм - тобто знаходження антитіл у структурі даної інфекції. Найкращим способом аналізу на наявність захворювання є культуральний спосіб - тобто так званий бактеріологічний посів, для діагностики якого потрібні проби зі слизової уретри, склепінь вологолища, з каналу шийки матки. Діагностуватися може, в тому числі і секрет простати, а також сеча, що виділяється рано вранці. При цьому взяті аналізи поміщаються в спеціальне живильне середовище, де протягом двох діб вирощуються уреаплазми. Число їх в організмі, можна визначити саме за допомогою культурального способу діагностики.
